Фамилия Пинекер образована от аналогичного прозвища, которое, скорее всего, восходит к немецкому нарицательному Pinnecke, которое является вариантом слова Pinie. В переводе с немецкого языка оно означает «сосна». Вполне вероятно, что данное прозвище указывало на особенности места жительства предка – недалеко от сосновой рощи. Так, в Книге памяти Карагандинской области упоминается заведующий сельхозартелью Пинекер Василий Васильевич, родившийся в 1910 году в Бальцерском районе.