Фамилия Пиперцианец — редкий случай, когда суффикс и окончание выдают происхождение носителя точнее, чем корень. Формант «-ец» в сочетании с основой на «-иан» (или «-ян») прямо указывает на то, что предок вышел из некой местности, название которой заканчивалось на «-ианы» или «-яны». В русской традиции так образовывали прозвища по месту жительства: «пиперцианец» — тот, кто родом из Пиперциан. Географическая привязка здесь первична.

Сама основа «Пиперци» звучит иноязычно, скорее всего, западнославянски или балкански. Наиболее правдоподобная версия — связь с польским или украинским словом «piperz» (перец) или с названиями ремесленников, торговавших пряностями. Однако фамилия могла возникнуть и от топонима: в Польше и на западе Украины встречаются микротопонимы вроде Пиперовка, Пиперово, а форма «Пиперци» — типичное для польских говоров множественное число, обозначающее жителей хутора или группы людей. То есть «Пиперцианец» — это «выходец из поселения Пиперцы».

Суффикс «-ан(ец)» в русских фамилиях характерен для выходцев с юго-западных земель (современные Беларусь, Украина, Польша). Так образовывались фамилии вроде Дубенец, Смолянец, а в данном случае — Пиперцианец. Фамилия не могла возникнуть в центральной России: модель «основа на -и + -анец» — признак западных говоров. Скорее всего, предок переселился в центральные губернии или на юг в XIX веке, и его прозвище закрепилось как фамилия.

Редкость фамилии объясняется её узкой географической привязкой: она почти не встречается за пределами западнорусских и украинских областей. Если искать однокоренные фамилии, то ближе всего стоят Пиперов, Пиперчук, Пиперский — все они восходят к тому же корню «перец», но с разными суффиксами. Пиперцианец стоит особняком: он говорит не о занятии (торговля перцем), а о месте, откуда человек родом.