Фамилия Пипидопуло — одна из тех, что сразу выдают греческие корни. Её основа — греческое имя или прозвище Πίπης (Пипис), которое восходит к детскому слову «пипи», обозначающему нечто маленькое или младенческое. В греческой ономастике такие уменьшительно-ласкательные прозвища нередко становились фамилиями, особенно когда к ним добавлялся суффикс -πουλος (-пулос), что значит «сын» или «потомок». Таким образом, Пипидопуло буквально переводится как «сын Пиписа» или «маленький Пипис».

Суффикс -пуло (в русской записи часто -пуло, -популо) — один из самых распространённых в греческих фамилиях, особенно в регионах Пелопоннеса и на островах. Он указывает на происхождение от конкретного предка, часто по мужской линии. В Российской империи фамилии на -пуло встречались среди греческих переселенцев, которые оседали в Причерноморье, на Кубани и в Крыму. Пипидопуло — типичный пример такой диаспорной фамилии, которая сохранила греческую модель словообразования, но адаптировалась к русскому окончанию (вместо классического греческого -пулос).

Важно различать: в самой Греции фамилия звучала бы как Пипидопулос (Πιπιδόπουλος), а в русском языке окончание «-о» закрепилось как калька с греческого родительного падежа или просто как упрощение при записи. Встречаются варианты написания: Пипидопулов (с русифицированным суффиксом -ов), но классическая форма без окончания — Пипидопуло — указывает на прямое заимствование.

Значение прозвища «Пипис» могло быть ироничным или просто бытовым. В греческом языке слово πιπί (пипи) — детское обозначение чего-то крошечного, и такое прозвище могли дать либо невысокому человеку, либо младшему в семье. В некоторых говорах Πίπης — это и форма имени Филипп (от Φίλιππος), но для фамилии Пипидопуло эта версия менее вероятна: слишком явная связь с детским словом, а не с полным именем.

В России фамилия остаётся редкой, даже на фоне других греческих фамилий вроде Константинопуло или Димитриу. Носители Пипидопуло в основном сосредоточены в Краснодарском крае и Ростовской области — регионах, куда в XIX веке переселялись греки из Османской империи. Никаких сведений о дворянском происхождении или массовой известности фамилии нет: это фамилия ремесленников, торговцев или крестьян, которые сохранили родовое имя в новой языковой среде.