Фамилия Пиписечкин — редкий пример, где за неблагозвучной для современного уха основой стоит вполне конкретное и безобидное ремесло. Вопреки догадкам, корень здесь не имеет отношения к обсценной лексике или анатомии. В основе лежит диалектное слово «пиписечка» — так в некоторых северных и сибирских говорах называли маленькую трубочку, дудочку, свистульку или узкий жестяной мундштук. Исходное прозвище Пиписечка могли дать мастеру, который делал такие вещи: лудильщику, жестянщику или изготовителю музыкальных игрушек.

Суффикс -ин указывает на типичную модель русских фамилий от прозвищ, оканчивающихся на -а/-я. Формально фамилия отвечает на вопрос «чей?» — то есть сын или потомок человека по прозвищу Пиписечка. Встречается она крайне редко, в основном в документах по Ярославской и Вологодской губерниям, что косвенно подтверждает северное происхождение корня.

В отличие от однокоренных фамилий вроде Пипкин или Пипин, где основа могла быть связана с уменьшительной формой имени (например, от Ипполит), Пиписечкин сохраняет прямую связь с конкретным предметом. В словаре русских фамилий Б. Унбегауна подобные единичные ремесленные прозвища не описываются, но словообразовательная модель здесь прозрачна: от орудия труда к прозвищу мастера, а затем к фамилии. Никакой тайны или двусмысленности в этом нет — только забытый говор и скромное ремесло.