Фамилия Пирамидина — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не профессия и не географическое название, а слово, пришедшее из книжной или церковной среды. Корень здесь — «пирамид(а)», и чтобы понять, как он мог стать фамилией, нужно отвлечься от привычной модели «сын такого-то». Окончание -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Пирамидин, то есть человек, имеющий отношение к пирамиде. Но в русской крестьянской или городской среде пирамиды не строили, так что связь иная.

Самая вероятная версия — происхождение от прозвища или семинарской фамилии. В духовных училищах XVIII–XIX веков будущим священникам нередко давали «искусственные» фамилии на латинский или греческий манер, образованные от возвышенных понятий: Гиацинтов, Рождественский, Пирамидов. Пирамида как символ вечности и мудрости вполне могла стать основой для такой фамилии. Позже, при переходе в светскую жизнь, она могла обрусе́ть и получить суффикс -ин, характерный для фамилий из полных основ (сравните: Гагарин — от «гагара», но Пирамидин — от «Пирамида»).

Возможен и более приземлённый вариант: в народе «пирамидой» называли стог сена, сложенный особым образом, или высокий головной убор. Человек, который выделялся ростом, носил высокую шапку или занимался укладкой сена, мог получить прозвище Пирамида. Но эта версия менее правдоподобна: такие прозвища обычно давали по более простым и понятным словам (Колокол, Шапка), а «пирамида» — слово книжное, малодоступное крестьянину.

Географически фамилия Пирамидина почти не встречается в исторических переписях, что подтверждает её позднее и, скорее всего, духовное происхождение. Она могла возникнуть в центральных губерниях России, где были семинарии, или у старообрядцев, которые тоже любили символические имена. Однокоренные фамилии — Пирамидов, Пирамидский — встречаются чаще, и Пирамидина, вероятно, их женская или обрусевшая форма.

Таким образом, предок носителя фамилии Пирамидина, скорее всего, был либо семинаристом, получившим «красивое» фамильное имя, либо человеком, чьё прозвище закрепилось за потомками в редкой и необычной форме.