Фамилия Пирнавская — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка первична, но сама география неочевидна. Формант -ск- прямо указывает на происхождение от названия места: Пирнава или Пирнав. Так могли назвать выходца из деревни, села или усадьбы с таким именем. Вопрос в том, где искать эту Пирнаву.

Самый вероятный корень — балтийский или западнославянский. В литовском и польском языках есть основа «pirn-», связанная с глаголами «парить», «преть» (ср. лит. pir̃ti — париться в бане). Тогда Пирнава — это топоним, возникший возле источника с горячей водой, паровой бани или просто сырого, туманного места. В белорусском Полесье и на бывших землях Великого княжества Литовского такие названия встречаются, хотя ни один крупный населённый пункт Пирнава сегодня не известен. Возможно, речь о хуторе, который исчез в XX веке.

Менее вероятная, но не исключённая версия — искусственное происхождение. В XIX веке семинаристам иногда давали фамилии по названиям церквей или икон (Богородицкий, Успенский). Пирнавская могла возникнуть от искажённого греческого или латинского слова, но убедительных параллелей нет. Поэтому версия с реальным топонимом остаётся основной.

Обратите внимание на окончание -ая. В русской традиции фамилии на -ский/-ская обычно носили дворяне и духовенство, но в XIX веке их активно получали и крестьяне при переписях, особенно в западных губерниях. Пирнавская — скорее всего, не старинная боярская фамилия, а поздняя, оформившаяся в XIX веке от названия конкретного места проживания. Это фамилия-указатель: «оттуда, где Пирнава». Носитель мог быть крестьянином, мещанином или священником — сословие без дополнительных документов не определить.

Сравните с однокоренными фамилиями: Пирнов, Пирнаков. У них та же основа, но суффикс -ов/-ев говорит о патрониме (сын Пирнака). Пирнавская же — чисто топонимическая, что и делает её уникальной: она не про отчество, а про малую родину предка, которую уже не найти на карте.