Фамилия Пищугина хранит память о прозвище дальнего предка, и расшифровка этого прозвища открывает интересные подробности о его характере или внешности. В основе фамилии лежит прозвище Пищуга, которое, по самой распространённой версии, образовано от глагола «пищать», то есть «издавать тоненький голосок, резкие звуки, близкие к визгу или свисту». Так могли прозвать человека с высоким, звонким голосом или того, кто говорил быстро и немного пискляво.

Однако есть и другая, не менее убедительная версия, которая связывает прозвище Пищуга с нарицательным словом «пичуга» — «маленькая птичка». В этом случае фамилия оказывается фонетическим вариантом более распространённого прозвища Пичуга. Смысл такого прозвища двоякий. С одной стороны, его давали человеку невысокого роста, хрупкого телосложения, который ассоциировался с маленькой птахой. С другой стороны, на Руси пичугой, пташкой нередко называли легкомысленного человека, не ведающего забот, живущего легко и беззаботно.

Существует и третья версия, более редкая, но любопытная. Она возводит прозвище Пичуга к глаголу «пичужить» — «красоваться, кокетничать». В таком случае прозвище носило ироничный оттенок и могло закрепиться за франтом, щеголем, который слишком много внимания уделял своей внешности. Выбрать какую-то одну версию сложно: все три правдоподобны, но первая, связанная с птичкой и маленьким ростом, выглядит наиболее естественной для народной традиции именования.

Сама фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Пищуг- добавился суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Таким образом, Пищугин — это «сын Пищуги», потомок человека, носившего это прозвище. Женская форма Пищугина — это та же фамилия, но в грамматическом роде, который относится к женщине.

Сведения о носителях фамилии встречаются в архивных документах разных регионов России, что говорит о её довольно широком распространении. В архивах УВД Воронежской области записан Пищугин Алексей Михайлович, родившийся в 1894 году в селе Грибановского района Воронежской области. В архивах воронежского общества «Мемориал» значится Пищугин Иван Захарович, родившийся в 1865 году. А в Книге памяти Республики Башкортостан упоминается Пищугин Матвей Антонович, родившийся в 1882 году. Эти записи, хоть и отрывочные, показывают, что фамилия бытовала в разных губерниях и у разных сословий, а сами Пищугины были обычными людьми, крестьянами и мещанами, чьи имена сохранились благодаря документальным свидетельствам эпохи.