Фамилия Пишикина — женская форма, мужская, соответственно, Пишикин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Пишика. Разберём, откуда оно могло взяться.

Самая прямая и очевидная версия — от глагола «пищать». Пишикой в русских говорах могли называть писклявого человека, ребёнка, который постоянно плачет или говорит тонким, высоким голосом. В некоторых диалектах «пишика» — это ещё и птенец, особенно тот, что пищит в гнезде. Прозвище могло закрепиться за человеком невысокого роста, худощавым или просто обладателем характерного голоса.

Вторая, менее распространённая, но тоже возможная версия — связь с глаголом «писать». В старину «писака» (и уменьшительное «пишика») — это ироничное прозвище грамотея, писаря или сочинителя. Если предок владел пером, его в шутку или с уважением могли назвать Пишикой. Суффикс -к- в этом случае имеет уменьшительно-пренебрежительный оттенок.

Фамилия образована по продуктивной модели на -ин. Это типичный патроним (отчество) от прозвища: «чей?» — Пишикин, то есть сын или потомок Пишики. Суффикс -ин указывает на принадлежность к роду. Географически фамилия встречается рассеянно, без ярко выраженного гнезда, что говорит о её прозвищном, а не топонимическом происхождении.

Спорных версий здесь немного. Гипотеза о связи с украинским или белорусским «пішы» (пиши) маловероятна — фамилия звучит как русская, с характерным для русского севера и центра суффиксом -ин. Скорее всего, первый носитель получил прозвище по голосу или по профессии, и фамилия закрепилась в крестьянской среде, где такие прозвища были обычным делом.