Фамилия Писюшкин — редкий пример, где основа прозвища уходит корнями не в профессию или внешность, а в диалектную лексику, связанную с растительным миром. Вопреки возможным догадкам, прямое отношение к обсценной лексике здесь маловероятно. Основная версия — происхождение от слова «писюшка», которое в ряде говоров (особенно в южнорусских и белорусских) обозначало маленькую шишку, почку растения или нечто мелкое, торчащее. Прозвище Писюшка могли дать человеку невысокого роста, щуплому, либо тому, кто имел какую-то характерную деталь во внешности — например, хохолок или клок волос, торчащий вверх.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Писюшкин — сын Писюшки. Модель образования типична для русских фамилий, возникших в крестьянской среде, где прозвища часто давались по бытовым, порой ироничным признакам. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые могли образовываться от календарных имён, -ин чаще закреплялся за прозвищами на -а/-я. Географически фамилия встречается спорадически, без ярко выраженного гнезда, но отдельные носители фиксируются в документах по Вологодской и Вятской губерниям — регионах, где диалектное слово «писюха» (в значении «шишка») было в ходу.

Существует и менее вероятная, но лингвистически возможная версия: связь с глаголом «писать» в древнем значении «рисовать, украшать». В таком случае Писюшкой могли прозвать грамотея или писаря, но эта гипотеза слабее, так как суффикс -юшк- в именах обычно придаёт уменьшительно-ласкательный оттенок, что характерно для прозвищ по внешности, а не по занятию. Фамилия Писюшкин — не дворянская, не купеческая; её носители, скорее всего, происходят из крестьян-однодворцев или государственных крестьян. Встретить её в старых родословных книгах почти невозможно, зато она попадается в ревизских сказках и метрических книгах XIX века — именно там и стоит искать корни конкретной семьи.