Фамилия Плисакина — женская форма фамилии Плисакин. С точки зрения словообразования это типичная русская «матронимическая» модель: суффикс -ин указывает на принадлежность, то есть Плисакина — «дочь или жена Плисаки». Мужская основа Плисакин в свою очередь образована по той же схеме от личного имени или прозвища Плисака.

Самая вероятная версия происхождения корня — от слова «плис» или «плиса». В русских говорах «плис» — это плотная хлопчатобумажная ткань, разновидность бархата. Прозвище Плисака могли дать торговцу плисом, портному, который шил из этой материи, или человеку, который любил носить одежду из плиса. Слово «плиса» также встречается в диалектах в значении «петля, складка», что связывает прозвище с портновским ремеслом или с какой-то характерной деталью одежды.

Менее распространённая, но возможная версия — связь с глаголом «плисать» (плескаться, шлёпать по воде). В этом случае прозвище могло закрепиться за человеком, жившим у воды или имевшим привычку ходить по лужам. Однако эта гипотеза слабее: глагол «плисать» — редкий, локальный, и его производные в фамилиях почти не встречаются.

Фамилия Плисакина — редкая, нечастотная. Её география тяготеет к центральным и южным регионам России, где бытовало слово «плис». Встречается в Рязанской, Тамбовской, Воронежской областях. Социально фамилия, скорее всего, крестьянская или мещанская: прозвища от названий тканей и ремёсел были распространены в среде посадских людей и сельских ремесленников.

По написанию фамилия устойчива: варианты с одной «с» (Плисакин) или с двумя (Плиссакин) встречаются, но первый вариант — основной. В словарях русских фамилий (например, в работах Б. Унбегауна) фамилия не фиксируется, что подтверждает её локальный и относительно поздний характер — она оформилась, скорее всего, в XVIII–XIX веках.