Фамилия Подготовкин — одна из тех, чья основа лежит на поверхности, но за кажущейся простотой скрывается неочевидный смысл. Сразу бросается в глаза глагол «подготовить», и возникает соблазн связать фамилию с человеком, который что-то готовил, подготавливал. Однако в русской ономастике прямой переход от глагола к фамилии — явление редкое. Чаще фамилии образовывались от прозвищ, а прозвища — от существительных, а не от инфинитивов.

Скорее всего, в основе лежит прозвище Подготовка. Так могли назвать человека по роду занятий: например, заготовщика сырья, подмастерья, который подготавливал материал для мастера, или работника, ответственного за подготовку инвентаря, инструмента, помещения. В крестьянском быту это мог быть помощник на мельнице, на бойне или на стройке — тот, кто «подготавливал» что-то для основного производства. Прозвище могло закрепиться и за расторопным, хозяйственным человеком, который всё заранее предусматривал.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: к основе «Подготовк-» добавили суффикс притяжательного прилагательного «-ин», указывающий на принадлежность: «чей?» — Подготовкин, то есть сын или потомок Подготовки. Суффикс «-ин» характерен для фамилий, образованных от слов женского рода или оканчивающихся на «-а», «-я». «Подготовка» — женского рода, поэтому закономерно дала «Подготовкин», а не «Подготовков».

Интересно, что фамилия очень редкая. В дореволюционных списках и современных телефонных справочниках она почти не встречается. Это может говорить о её позднем возникновении — возможно, в XIX веке, когда фамилии активно давали бывшим крепостным по прозвищам или по профессиям, которые не были широко распространены. В отличие от массовых Кузнецовых или Поповых, Подготовкины могли произойти из одной локальной местности, где прозвище было в ходу в одном селе или у одной семьи.

Никаких известных исторических личностей с этой фамилией не зафиксировано, что подтверждает её исключительно прозвищное, бытовое происхождение. Спорных версий, кроме прямой глагольной, нет: корень ясен, суффикс стандартен. Единственный момент, который стоит отметить — ударение. Логично падает на третий слог: Подгото́вкин, но в живой речи из-за редкости фамилии возможны колебания.