Фамилия Подгрудков — один из тех случаев, когда прозвище, лёгшее в основу, сохранилось почти без изменений. Это отчество второго порядка: сначала было прозвище Подгрудок, затем от него образовалось отчество Подгрудков (сын Подгрудка). Суффикс -ов указывает на принадлежность, типичную для русских фамилий, сформировавшихся в центральных и северных регионах России в XVI–XVII веках.

Корень здесь прозрачный: «под грудой» или «под грудью». Но что конкретно означало слово «подгрудок»? У него два основных значения. Первое — бытовое, анатомическое: так называли нижнюю часть груди, подгрудную впадину, а также кожную складку или второй подбородок. Второе — ремесленное, портновское: это часть одежды, нашитая под грудью, или фартук, передник, который закрывал грудь и живот. В некоторых говорах «подгрудком» называли и особый вид женской безрукавки.

Скорее всего, прозвище Подгрудок получил человек с заметной, выдающейся нижней частью груди — либо полный, либо с характерной осанкой. Прямые прозвища по частям тела в русской ономастике обычны: Губа, Нос, Щека, Лоб. Подгрудок — из того же ряда, но гораздо реже. Встречается и версия, что прозвище дали портному или торговцу, который шил или продавал «подгрудки» — фартуки. Однако первая версия, антропологическая, выглядит правдоподобнее: прозвища по внешности давали чаще, чем по предмету ремесла.

Фамилия редкая. Встречается в основном на юге России, в Ростовской области и Краснодарском крае, а также в Поволжье. Это говорит о том, что носители, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми — среди дворянства такие «прозрачные» прозвищные фамилии почти не встречались. В дореволюционных метрических книгах можно найти единичные записи, но массового распространения фамилия не получила.

Ударение в фамилии ставится на второй слог: Подгру́дков. Вариант с ударением на последний слог (Подгрудко́в) возможен, но менее традиционен для фамилий на -ов.