Фамилия Подкладышев — редкий пример того, как бытовое действие или предмет становятся устойчивым родовым именем. Её основа — глагол «подкладывать» или существительное «подкладка». В отличие от фамилий, образованных от имени или профессии, эта напрямую отсылает к конкретному занятию: подкладышевым могли называть того, кто изготавливал подкладки для одежды, обуви или даже для седла. В ремесленной среде такие прозвища давали по самой заметной детали работы.

Словообразовательная модель проста: корень «подклад-», суффикс «-ыш» (уменьшительно-пренебрежительный или указывающий на предмет, как в «глупыш», «крепыш»), и далее типичный русский суффикс принадлежности «-ев». Фамилия на «-ев», а не на «-ов», объясняется тем, что основа оканчивается на мягкий или шипящий согласный (в данном случае «ш»). По происхождению это типично великорусская фамилия, распространённая в центральных и северных губерниях, где было развито портновское и сапожное ремесло.

В ономастике встречается и альтернативная версия: прозвище Подкладыш могло относиться к человеку, который постоянно «подкладывал» — то есть подлизывался, угождал, занимался подхалимством. Однако такая трактовка менее вероятна: в русских говорах слово «подкладыш» зафиксировано именно как название подкладки (например, у Даля — «подкладка под хомут» или «подбой под шапку»). Прозвища по ремеслу всегда перевешивают психологические характеристики.

Стоит отметить редкий суффикс «-ыш» в основе. В русских фамилиях он встречается нечасто: Подкладышев стоит в одном ряду с такими же единичными примерами, как Кудряшов или Малышов. Это придаёт фамилии отчётливую народную, диалектную окраску — её носитель почти наверняка происходил из среды мастеровых людей, а не из дворян или духовенства.

Известных исторических деятелей с этой фамилией не зафиксировано, что типично для прозвищных фамилий ремесленников: они оставались в своей среде и редко попадали в документы высших сословий. Сегодня Подкладышевы встречаются в основном в Поволжье и на Урале, что подтверждает связь с плотницким и швейным промыслами, которые были распространены именно там.