Фамилия Подояхина — женская форма от Подояхин, и её происхождение напрямую связано с необычным прозвищем, которое давали человеку по поведению или профессии. Основа фамилии — глагол «доить» с приставкой «подо-». В старину «подоить» означало не просто подоить корову, а сделать это тайком, украдкой, присвоив чужое молоко. Соответственно, Подояха — тот, кто промышлял таким воровством. Прозвище звучало резко и осуждающе, но в русской деревне подобные «говорящие» имена давали без злого умысла, скорее как меткую характеристику, которая закреплялась за человеком и его потомками.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын Подояхи, дочь Подояхина). Само прозвище образовано с помощью продуктивного суффикса -ях(а), который в северных и центральных говорах придавал слову оттенок просторечия и фамильярности (сравните: гуляка, работяга, бедняга). Таким образом, Подояха — это не столько кличка, сколько бытовое именование человека с определённым пороком или привычкой.

Встречается фамилия преимущественно в регионах, где было развито молочное скотоводство и частые случаи мелкого сельского хищения — например, в бывших Вятской, Пермской, Костромской губерниях. В словаре русских фамилий Б. О. Унбегауна подобные образования упоминаются в разделе прозвищ, связанных с действиями, хотя конкретно «Подояхин» не фигурирует — это редкий вариант, сохранившийся скорее в устной традиции.

Спорные версии — например, связь с диалектным «подой» (сосуд для молока) или с именем Подой (гипотетическое уменьшительное от какого-либо канонического имени) — кажутся маловероятными. Прозвищная основа «подоить» объясняет фамилию проще и правдоподобнее, без натяжек. Социальный контекст: носители фамилии, скорее всего, происходили из крестьян-земледельцев или скотников, а само прозвище могло закрепиться за одним нечистым на руку предком, чей поступок запомнили соседи.