Фамилия Поглубко не входит в число самых распространённых, но её происхождение прозрачно и уходит корнями в мир прозвищ. Основа здесь — глагол «поглубеть» или наречие «глубоко». В восточнославянской традиции так могли прозвать человека, жившего в глухом, отдалённом месте, в чаще или низине, либо того, кто отличался вдумчивым, «глубоким» характером. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые образуются от притяжательных прилагательных («чей?»), модель на -ко типична для украинской и белорусской антропонимии. Суффикс -к- в данном случае выполняет уменьшительно-ласкательную или, чаще, нейтральную функцию, превращая прозвище Поглуб(ый) в фамилию. Таким образом, Поглубко — это «сын Поглубого» или просто человек, носивший прозвище Поглубко.

Интересно, что фамилия сохранила ударение на втором слоге: Поглу́бко. Встречается она преимущественно на западе современной Украины и в южных областях Беларуси, что подтверждает её западнорусское происхождение. В этих регионах фамилии на -ко — одни из самых массовых, и Поглубко стоит в одном ряду с такими же «географическими» или «характерологическими» прозвищами, как Глушко (от «глушь») или Далько (от «даль»). Словообразовательная модель проста: приставка по- + корень -глуб- + суффикс -к- + окончание -о. Приставка по- в прозвищах часто указывала на признак или место: Поглу́бко — тот, кто находится «по глубине», «у глубины».

В дореволюционных метрических книгах фамилия фиксировалась с вариациями: Поглубко, Поглубка, Поглубков. Последний вариант — результат русификации, когда украинское окончание -ко заменили на русское -ков. Однако в основной массе носителей фамилия сохранила исходную форму. Сословно предки Поглубко в большинстве были крестьянами или казаками, поскольку сложные прозвища редко закреплялись за дворянством. Прямых указаний на род занятий прозвище не даёт, но можно предположить, что первый носитель мог жить в овраге, у глубокого колодца или просто слыл человеком не поверхностным — в прямом или переносном смысле. Спорных версий у фамилии нет: она однозначно происходит от восточнославянского прилагательного «глубокий» и не имеет тюркских или балтийских корней.