Фамилия Полфунтикова — женская форма, образованная от мужской фамилии Полфунтиков. Её основа — прозвище Полфунта, которое в XVI–XVII веках могло относиться к человеку маленького роста или невысокого веса. В быту «полфунта» (около 200 граммов) было ходовой мерой, и такое прозвище давали либо щуплому, лёгкому человеку, либо, с иронией, — тщедушному младенцу или подростку. Модель образования типична для русских фамилий: прозвище на -а плюс патронимический суффикс -ов (Полфунтов → Полфунтиков), который затем перешёл в женскую форму через -а.

Главная особенность фамилии — её редкая словообразовательная модель. В русской ономастике прозвища, образованные от дробных мер (полушка, полтина, полкопейки), встречаются, но «полфунта» — случай нечастый. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» упоминаются фамилии от названий мер веса (Пудов, Фунтов), а Полфунтиков стоит в ряду более сложных прозвищ, где к мере добавляется конкретная доля. По сути, это прозвище-характеристика, а не указание на ремесло или занятие: предок Полфунтиковых не торговал гирями, а получил кличку за внешность.

Региональная привязка фамилии неочевидна. В переписных книгах XVII века и в метриках XIX века она встречается спорадически — в основном в центральных губерниях (Московская, Тверская, Рязанская), но без массового скопления. Это говорит о том, что фамилия не возникла в одном селе, а появлялась в разных местах независимо: если в деревне жил человек по прозвищу Полфунта, его дети автоматически становились Полфунтовыми. Суффикс -ик- (Полфунтик → Полфунтиков) мог появиться как уменьшительная форма от Полфунта, что усиливает ироничный оттенок прозвища — «совсем кроха».

Встречается и вариант с ударением на второй слог — Полфунти́кова, что соответствует старому произношению меры «фунт» с ударением на «у». В современном русском языке фамилия может произноситься по-разному, но исторически верным считается ударение на «и»: Полфунти́ков.