Фамилия Полипартова звучит необычно для русского уха, и это ключ к её разгадке. В основе, скорее всего, лежит не славянский, а греческий корень. «Поли» — по-гречески «много», а «парт» может восходить к слову «parthenos» — «дева», «девственница». Самая прямая аналогия — имя Полипарфена, что означает «многодевственная» или «имеющая много дев» (в смысле служащих или спутниц). В русской традиции имя Полипарфен (мужская форма) встречалось в святцах, но было редким, а фамилия от него — Полипарфенов. Форма Полипартова — это, вероятно, более позднее фонетическое упрощение: «ф» в живой речи могло перейти в «т» (явление, известное как ассимиляция), или же произошла замена под влиянием более привычного суффикса -ов.

Модель образования здесь — притяжательное прилагательное с суффиксом -ов, отвечающее на вопрос «чей?». Полипартов — значит «сын Полипарта». А Полипарт, в свою очередь, — это усечённая или просторечная форма от церковного имени Полипарфен. Такое сокращение (как, например, от Агафон — Агап, от Феофан — Фофан) было типично для крестьянской и мещанской среды: длинное имя резали до привычного трёхсложного звучания.

Носители фамилии встречаются в основном в центральных областях России, но особенно часто — в Тверской и соседних губерниях. Там, в среде старообрядцев и просто крестьян, дольше сохранялись редкие календарные имена. Предок-носитель такого имени мог быть грамотным причетником, сельским священником или просто человеком, которого в семье назвали в честь святого мученика Полипарфена (память 7 марта по старому стилю). Второй, более прозаичный вариант, не связанный с греческим: прозвище «Полипар» для человека, который много и тяжело парится (от глагола «парить»), но это спорно, так как суффикс -т- в таком случае нехарактерен. Более правдоподобна версия с греческим именем, пусть и сильно изменённым.