Фамилия Полуницкая — вариант женского рода от Полуницкий, и её разговор стоит начать с неочевидного: суффикс -ицк- здесь указывает не на географическое происхождение (как в типичных «-ский» от названий сёл), а скорее на притяжательность или принадлежность. В русской ономастике суффикс -ицк- встречается реже, чем -овск- или -инск-, и часто закрепляется за фамилиями, образованными от прозвищ или личных имён с мягкой основой. В данном случае основа «Полун-» ведёт к слову «полуница» — это диалектное название земляники, распространённое в южнорусских и украинских говорах. Полуницей называли не только ягоду, но и человека: так могли прозвать собирателя ягод, торговца ими или просто человека с румяным, «ягодным» лицом.

Вторая версия, менее растительная, но не менее правдоподобная: основа может восходить к древнерусскому имени или прозвищу Полуня — уменьшительной форме от Полуект (церковное Полиевкт) или от Полукарп (Поликарп). В бытовой речи такие имена стягивались: Полуня, Полунька. Тогда Полуницкий — сын Полуни, а Полуницкая — его жена или дочь. Фамилии на -ицкий в этом случае фиксировали принадлежность к конкретному роду, а не к местности.

География фамилии подсказывает: Полуницкие встречаются в основном в западных и южных регионах бывшей Российской империи — на Украине, в Белоруссии, в Смоленской и Брянской областях. Это совпадает с ареалом слова «полуница» и с традицией образования фамилий от прозвищ, а не от топонимов. В дворянских родословных книгах фамилия не значится — скорее всего, предки Полуницких были крестьянами или мещанами, а фамилия закрепилась в XIX веке при переписях.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Полунин, Полуничев, Полуняев — показывает, что Полуницкий стоит особняком: в ней нет патронимического суффикса -ин или -ов, а есть именно -ицк-, что роднит её с фамилиями польского или западнорусского образца. Возможно, носители фамилии имели шляхетские корни, но потеряли статус, или фамилия возникла на землях, где смешались русская и польская ономастические традиции.