Фамилия Пожилкина — женская форма, а её мужской вариант Пожилкин образован от прозвища или нецерковного имени Пожилка. В основе лежит слово «жилка» с приставкой «по-». Чаще всего так в старину называли человека с заметными, выступающими венами на руках или ногах — это была простая, наглядная примета. Возможен и переносный смысл: на Руси «жилкой» именовали скупого, прижимистого человека, а приставка «по-» могла указывать на склонность к такому поведению («пожилистый» — то есть себе на уме, расчётливый). Однако первая версия — по внешнему признаку — выглядит правдоподобнее, поскольку прозвища по физическим особенностям давали особенно часто.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын Пожилки). Это так называемые «патронимические» фамилии, но в данном случае основой стало не крестильное имя, а прозвище. Фамилия Пожилкин — сравнительно редкая, её нет в массовых списках дворянских или купеческих родов. Скорее всего, предки носителя относились к крестьянскому или мещанскому сословию: такие «бытовые» прозвища закреплялись в среде, где людей называли не по отцу, а по характерной черте.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России. Встречается в архивных записях по Вологодской, Костромской и Ярославской губерниям — там, где хорошо сохранилась традиция бытовых прозвищ. В переписных книгах XVII–XVIII веков можно найти упоминания крестьян с прозвищем Пожилка, но точных дат и имён без специального разыскания не назвать.

Интересная деталь: фамилия Пожилкин стоит в одном ряду с однокоренными Жилкин, Жилов, Пожилов. Но если Жилкин мог образоваться и от имени Жила (сокращение от Жирослав), то Пожилкин такой вариант исключает — приставка «по-» явно указывает на прозвищный характер. Это хороший пример того, как морфология помогает отсеять ложные версии происхождения.