Фамилия Прушковская — яркий пример польско-белорусской модели образования фамилий, которая закрепилась и в восточнославянской среде. Её основа — топоним, то есть название населённого пункта, а суффикс -ск-/-цк- указывает на связь с местностью.

Корень «Прушк-» восходит к названиям вроде Прушки, Прушково или Прушков. Такие деревни и хутора встречаются в Польше, Беларуси и на западе Украины. Само слово «Прушки» — это, скорее всего, уменьшительная форма от «Прусы» или «Пруссия». В польской ономастике так нередко называли поселения выходцев из Пруссии или места, где жили пруссы (балтское племя, а не немцы). Впрочем, есть и более приземлённая версия: «прушок» в польских говорах могло означать «прутик», «веточка» или даже «таракан» (prusak). Прозвище по такой основе маловероятно для фамилии на -ский, но полностью исключать её нельзя.

Фамилия Прушковская — женская форма. Мужской вариант — Прушковский. Носительница такой фамилии — потомок человека, который либо владел землёй в Прушкове, либо был оттуда родом. В Польше и на западе Беларуси фамилии на -ский/ -цкий традиционно носили шляхта и зажиточные крестьяне, но к XIX веку они распространились и среди простых людей, особенно после отмены крепостного права, когда многие брали фамилии по названию родной деревни.

Если искать аналоги, то однокоренные фамилии — Прушков, Прушко, Прушкевич. Первая — русская модель с суффиксом принадлежности (-ов), вторая — украинско-белорусская уменьшительная форма, третья — патроним с суффиксом -евич. Прушковская стоит особняком: её «шляхетский» суффикс часто указывает на более высокий социальный статус предка или на то, что фамилия закрепилась в письменных документах (метриках, ревизских сказках) именно в такой форме.

Географически фамилия Прушковская сегодня встречается в Беларуси (особенно в Гродненской и Брестской областях), в восточной Польше и среди потомков эмигрантов в России и Украине. Это не массовая фамилия, а довольно редкая, что типично для фамилий, образованных от небольших локальных топонимов.