Фамилия Пруцких напрямую связана с прозвищем Пруцкий, которое когда-то дали предку. В основе этого прозвища лежит диалектное слово «пруц», означающее «брус». Поэтому логично предположить, что прозвище относилось к разряду «профессиональных» именований: так могли называть человека, который работал со строительным материалом, например, плотника или строителя. В некоторых говорах встречается и уменьшительная форма «прутец», которая также могла лечь в основу именования.

Сама модель образования фамилии типична для северорусских и сибирских говоров. Окончание -их (а в данном случае форма родительного падежа множественного числа — Пруцких) указывает на принадлежность к роду, к семье: Пруцких — это «из семьи Пруцкого». Такие фамилии часто закреплялись за целыми династиями и передавались по наследству без изменений, в отличие от более распространенных в центральной России -ов/-ев.

Прозвище Пруцкий могло закрепиться за человеком как основное имя, вытеснив крестильное, если он был известен в округе именно своим ремеслом. Со временем эта форма стала фамилией, и потомки человека, которого звали Пруцкий, получили фамилию Пруцких. Стоит отметить, что в некоторых случаях нельзя полностью исключать связь с географическим названием, например, с рекой Прут, но для диалектного «пруц» версия о ремесле выглядит более убедительной, поскольку она объясняет конкретное значение слова, а не просто созвучие. Так или иначе, фамилия Пруцких хранит память о предке, которого в округе знали по делу, связанному с обработкой дерева или строительством.