Фамилия Пупсяткин звучит курьёзно, но за ней стоит вполне прозрачная и даже трогательная история. Вопреки ожиданиям, её основа — не взрослый «пупс», а уменьшительно-ласкательное прозвище. В русских говорах «пупсёнок», «пупсятко» или «пупся» — это не кукла, а маленький ребёнок, карапуз, пухлый и румяный младенец. Так в семье или в деревне могли ласково называть позднего, долгожданного или просто самого младшего ребёнка.

Модель образования здесь редкая и показательная. Фамилия построена по схеме «прозвище + суффикс принадлежности -ин». Суффикс -ин в русских фамилиях обычно присоединяется к основам на -а/-я: Пупсятк(а) → Пупсяткин. Получается, что Пупсяткин — это буквально «чей?» — сын или внук того самого Пупсятки. Такая форма типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин столь же распространены, как и на -ов.

В отличие от фамилий вроде Пупков или Пупочкин, где корень может отсылать к пупку как части тела (и связанным с ним прозвищам), Пупсяткин идёт напрямую от детского прозвища. Это не прозвище взрослого человека, а скорее семейное, внутриродовое имя. Предок, получивший такое прозвище в детстве, мог сохранить его на всю жизнь, и оно перешло к потомкам как фамилия. Встречаются также варианты Пупсяткин и Пупсёнкин — все они одного корня.

В официальных источниках фамилия встречается редко, что говорит о её локальном бытовании. Скорее всего, она возникла в одной или нескольких соседних деревнях, где прозвище было в ходу, а затем разошлась по стране с переселенцами. Никакой дворянской или купеческой истории у этой фамилии нет — она чисто крестьянская, народная, возникшая в среде, где детей называли не по святцам, а по сердцу.