Фамилия Пяткун представляет собой фонетический вариант фамилии Петкун, которая образована от аналогичного имени. Петкун — это славянская просторечная форма крестильного имени Петр. Само же имя Петр в переводе с древнегреческого означает «камень, скала». Также возможно, что в основе фамилии лежит другая форма имени Петр, звучавшая как Петка. В этом случае компонент -ун является фамильным суффиксом и указывает на возможное украинское происхождение фамилии Пяткун.