Фамилия Пыхыр — редкая и неочевидная с первого взгляда. Чтобы понять её происхождение, проще всего оттолкнуться от живого русского слова «пыхтеть», «пыхнуть». Прозвище Пыхыр могли дать человеку тяжелому на подъём, медлительному или, наоборот, тому, кто работал с натугой, пыхтел за работой. В говорах «пыхать» означало также «сильно дуть», «дышать с шумом» — так могли окрестить толстяка или кузнеца, раздувающего меха.

Словообразовательная модель здесь нестандартная. В русских фамилиях часты суффиксы -ов, -ин, -ский, а Пыхыр заканчивается на твёрдый согласный и не имеет патронимического суффикса. Это указывает на то, что перед нами не отчество, а застывшее прозвище в чистом виде. Фамилии такого типа (Косарь, Гуляй, Пыхыр) характерны для украинской и южнорусской традиции, где прозвище часто переходило в фамилию без изменений.

Вторая, менее очевидная версия отсылает к диалектному слову «пыхырь» — так в некоторых областях называли пузырь, волдырь или нарыв. Тогда прозвище могло быть связано с внешностью: человек с заметной родинкой, опухолью или просто с округлыми чертами лица. Эта гипотеза правдоподобна, но уступает первой по частотности употребления корня в антропонимии.

Географически фамилия Пыхыр встречается точечно — преимущественно на юге России и в восточных областях Украины. В дореволюционных переписях она не фиксировалась массово, что говорит о локальном происхождении: скорее всего, предок получил прозвище в одном селе или хуторе, а потомки разнесли фамилию по окрестностям.

Сравните с однокоренными Пыхов, Пыхтин, Пыхалов. У них прозвищная основа та же, но оформление разное: суффиксы -ов и -ин делают их типичными русскими фамилиями, тогда как Пыхыр сохранил архаичную «голую» форму. Именно это и делает её ценной для этимолога — она как будто законсервировала живое прозвище XVII–XVIII веков, не тронутое канцелярской унификацией.