Фамилия Пыпников образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Пыпников образована от прозвища Пыпник, которое, вероятно, восходит к слову «пыпа». Пыпой во Владимирской области называют овсяную или ячневую муку. Таким образом, прозвище Пыпник относится к профессиональным именованиям, указывающим на род деятельности предка: он мог быть пекарем или мельником, который изготавливал овсяную или ячневую муку. Не исключено также, что прозвище Пыпник восходит к украинскому существительному «пипа» («пыпа»), то есть «мера вина, бочка в 40-50 ведер». Следовательно, основатель рода Пыпниковых мог быть и виноделом. Так, из «Ономастикона» Веселовского известны: Иван Пыпа (крестьянин, 1495 год, Новгород), Игнат Алексеев Пыпа (посадский человек, 1635 год, Можайск), Василий Пыпин (крестьянин, 1475 год, Дмитров). По другой версии, прозвище Пыпник образовано от глагола «пыпнить», что значит «копаться, медлить, мешкать». Таким образом, прозвище Пыпник могло указывать и на нерасторопность предка. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пыпник, со временем получил фамилию Пыпников. О точном месте и времени возникновения фамилии Пыпников в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Пыпников представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.