Фамилия Рахмаджанова — яркий пример того, как тюркские и арабские корни сплелись в русской ономастике. Её основа — мужское имя Рахмаджан, которое состоит из двух частей. Первая, «рахмат», восходит к арабскому слову «милость», «сострадание» (один из эпитетов Аллаха — Ар-Рахман, Милостивый). Вторая часть, «джан», — персидского происхождения, означает «душа», «жизнь» или «дорогой, любимый». Вместе имя Рахмаджан можно перевести как «милость души» или «милосердная душа». Это составное имя особенно распространено у народов Средней Азии и Поволжья — татар, башкир, узбеков, таджиков.

Фамилия образована по русской модели: к основе Рахмаджан добавили патронимический суффикс -ов, а затем женское окончание -а. Мужской вариант — Рахмаджанов. В русской традиции такие фамилии закреплялись за детьми и внуками человека по имени Рахмаджан, указывая на принадлежность к роду. В отличие от фамилий с суффиксом -ин (от основ на -а, -я), здесь сработала модель для основ, оканчивающихся на согласный.

Встречается фамилия в основном в регионах с татарским и башкирским населением — в Татарстане, Башкортостане, а также в Узбекистане и Таджикистане, где имя Рахмаджан более привычно. В русских документах фамилия могла фиксироваться с разными ударениями, но чаще ударение падает на последний слог основы — Рахмаджа́нова. Интересно, что в некоторых тюркских языках имя могло произноситься как «Рахманджан» с носовым звуком, но в письменной форме закрепился вариант без «н».

Социально фамилия не несёт указания на дворянство или духовное сословие: это типичная «именная» фамилия, возникшая в крестьянской или мещанской среде. Если предки носили её в Российской империи, они, скорее всего, были крестьянами или мелкими торговцами из мусульманских общин. В советское время фамилия распространилась шире за счёт миграций, но сохранила яркую этническую окраску. Среди носителей фамилии нет широко известных исторических фигур, что говорит о её «народном», а не аристократическом происхождении.