Фамилия Рахматжанов — тюркская по происхождению, но с арабским корнем в основе. Её носители — почти всегда люди из Средней Азии или их потомки, чаще всего узбеки, таджики или казахи. Фамилия образована по русской патронимической модели: к восточному личному имени добавили русский суффикс -ов, означающий «сын» или «принадлежащий». То есть Рахматжанов буквально — «сын Рахматжана».

Имя Рахматжан составное. Первая часть — Рахмат — восходит к арабскому «рахма» (милость, сострадание). В исламской традиции это одно из ключевых понятий: Аллах часто именуется Ар-Рахман (Милостивый). Вторая часть — жан — в тюркских языках означает «душа» или «жизнь». Таким образом, Рахматжан можно перевести как «милость души» или «душа милости». Это типичное для региона сложносоставное имя с пожелательным смыслом: родители надеялись, что ребёнок вырастет добрым, милосердным человеком.

Интересная деталь: в русской записи фамилия сохранила тюркское произношение — с ударением на последнем слоге (Рахматжа́нов), хотя по правилам русской грамматики ударение в фамилиях на -ов часто падает на третий слог с конца. Это указывает на недавнее вхождение фамилии в русский язык: её не переделывали под местные нормы, а записали так, как слышали. В советское время, при паспортизации среднеазиатских народов, многие подобные фамилии закрепились именно в такой форме — с суффиксом -ов и сохранением исходного ударения.

Встречается также вариант Рахматжанов с буквой «х» в середине — это не ошибка, а отражение местного произношения, где звук «х» может быть более мягким или фарингальным. Но в русском написании стандартом стало именно «Рахматжанов».

Социально фамилия не указывает на дворянство или какое-то сословие. Её носители в XIX — начале XX века были в основном крестьяне, ремесленники или торговцы в городах Ферганской долины, Ташкента, Самарканда. После 1917 года, с отменой сословных перегородок, фамилия распространилась шире, но её географическая привязка осталась прежней: Узбекистан, Таджикистан, юг Казахстана.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Рахматжанов стоит в одном ряду с Рахматовым, Рахматуллиным, Рахмановым. Но отличие в том, что компонент «жан» делает её более личной, нежели просто «Рахматов» (сын Рахмата). Это распространённая модель в узбекской антропонимии: добавлять к имени «жан» для усиления ласкового или почтительного оттенка.