Фамилия Рахторина образована от мужского имени или прозвища Рахтора с помощью типичного русского суффикса принадлежности -ин. Суффикс -ин указывает на то, что основатель рода — человек, которого называли Рахтора. В русской ономастике это одна из самых распространённых моделей: она отвечает на вопрос «чей?» и буквально значит «сын (или потомок) Рахторы».

Сам корень — неочевидный и редкий. Вероятнее всего, он восходит к тюркскому или арабскому слову «рахмат» (милость, благодать) или «рахман» (милостивый). В тюркских языках форма «рахтор» могла возникнуть как фонетическое видоизменение: выпадение конечного «т» или «н» и переход в «р» — явление нередкое при заимствовании. Если это так, то Рахтора — это прозвище, данное человеку с мягким, добрым нравом, или же имя-пожелание от родителей, надеявшихся на божественное покровительство.

Менее вероятная версия — связь с диалектным русским словом «рахта», которое в некоторых говорах означало «неуклюжий человек» или «размазня». Однако эта гипотеза слабая: слово «рахта» почти не встречается в письменных источниках, а фамилия явно тяготеет к южным и восточным регионам России, где тюркское влияние сильнее.

Фамилия Рахторина — женская форма, указывающая на принадлежность к роду Рахториных. В русской традиции такие фамилии не склонялись по падежам как прилагательные, а оставались неизменными, что закрепилось в официальных документах. Географически Рахторины встречаются в Поволжье, на Урале и в Сибири — местах, где исторически смешивались славянские и тюркские общины.

Таким образом, носитель фамилии Рахторина с большой долей вероятности происходит от человека с тюркским именем-прозвищем Рахтора, означающим «милостивый» или «благодатный». Фамилия редкая, и её корень — яркий пример того, как русская словообразовательная модель сохранила иноязычное слово, давно исчезнувшее из живого обихода.