Фамилия Ракшаева — женская форма фамилии Ракшаев, и ее происхождение напрямую связано с прозвищем или именем Ракша. В основе лежит тюркское слово «ракша» (или «ракыш»), которое в разных тюркских языках имеет значения «свет», «сияние», «блеск», «молния». Встречается и более конкретное толкование: у народов Поволжья и Приуралья так могли назвать человека с яркой, заметной внешностью — светловолосого, с быстрым взглядом или вспыльчивого, «как молния».

Модель образования типична для русских фамилий восточного происхождения: к основе Ракша добавили патронимический суффикс -ев (вариант -ов после мягкого согласного). Суффикс указывает на принадлежность: Ракшаев буквально значит «сын Ракши», а Ракшаева — «дочь/жена Ракшаева». Фамилия не получила широкого распространения по всей России, она тяготеет к регионам, где исторически был силен тюркский субстрат: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская и Челябинская области. Встречается также среди мордвы-эрзи, что указывает на заимствование прозвища через соседние тюркские народы.

В русских говорах слово «ракша» имело и другое значение — так называли птицу-сойку, известную ярким оперением и громким криком. Поэтому существует вторая, менее вероятная версия: прозвище Ракша могли дать человеку за пестроту в одежде или за резкий, скрипучий голос. Однако фонетический облик фамилии и ее география уверенно склоняют к тюркскому корню. В пользу этого говорит и то, что в тюркской ономастике встречается имя Ракыш (например, у казахов), а русские фамилии на -аев (-аева) часто образуются именно от таких основ.

Сословная принадлежность у Ракшаевых была разной. В документах XIX века встречаются как крестьяне и мещане из южных уездов Уфимской губернии, так и представители духовенства — например, в Оренбургской епархии. В советское время фамилия оставалась редкой, не перешла в разряд массовых. Сейчас носительницы фамилии Ракшаева живут в основном в тех же регионах, что и сто пятьдесят лет назад, хотя миграции разнесли ее по всей стране.