Фамилия Рэбанэ — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не связано с исконно русскими словообразовательными моделями. В ней нет привычных суффиксов -ов, -ин или -ский, которые указывали бы на принадлежность отцу или местность. Основа «Рэбан-» и окончание «-э» (в русском языке обычно передающееся как -е) заставляют искать корни за пределами восточнославянских земель.

Вероятнее всего, фамилия имеет молдавское или румынское происхождение. В румынском языке слово «rebean» (или «rebea») может быть связано с прилагательным «rebeag» — «упрямый», «своенравный». В таком случае прозвище Рэбанэ (Rebane) давали человеку с непростым, стойким характером. Суффикс «-е» в румынских фамилиях часто выполняет роль родительного падежа или просто оформляет фамилию как имя собственное, что типично для этого региона.

Другая, менее вероятная, но возможная версия — эстонские или финно-угорские корни. В эстонском языке слово «rebane» означает «лиса». Если фамилия попала в русскую среду через прибалтийские территории, её могли носить потомки эстонских переселенцев или крестьян, получивших прозвище по промыслу (охотник на лис) или по внешнему сходству (хитрый, рыжий человек). Однако написание через «э» (Рэбанэ) скорее говорит о молдавском влиянии, где буква «э» встречается чаще, чем в эстонской передаче (обычно «Ребане»).

Географически фамилия Рэбанэ встречается в основном на юге России и в Приднестровье, что подтверждает первую гипотезу. В дореволюционных метрических книгах Бессарабской губернии можно найти записи о крестьянах и мещанах с такой фамилией. Сословно носители чаще всего были крестьянами или ремесленниками, так как дворянские роды с подобной основой не фиксируются. Таким образом, носитель фамилии Рэбанэ, скорее всего, потомок выходца из молдавских земель, которого прозвали упрямым или стойким человеком.