Фамилия Ремперлин — редкая и необычная для русского уха, и её происхождение почти наверняка не русское, а еврейское (ашкеназское). Об этом говорят и характерный суффикс -ин, и основа, которая не встречается в славянских именах или прозвищах.

Скорее всего, в основе фамилии лежит немецкая или идишская фамилия Remperlin. В таком случае она образована от названия местности или от личного имени. Первый вариант: город Ремплин (Remplin) в земле Мекленбург-Передняя Померания на севере Германии. Еврейские фамилии, оканчивающиеся на -ин, часто давали по названию города, откуда человек родом, с добавлением суффикса принадлежности. Получается, Ремперлин — это «тот, кто из Ремплина». Второй вариант: от уменьшительной формы имени Ремпель (Rempel), которое в свою очередь — вариант имени Рафаэль или Рем (Reem, от ивритского «единорог»). Тогда суффикс -ин указывает на родство: «сын Ремпеля» или «принадлежащий Ремпелю».

Написание через «е» после «р» (Ремперлин, а не Ремплин) — это типичная для XIX века адаптация немецкого звучания при записи в метрических книгах на территории Российской империи. Фамилия встречается в основном среди еврейского населения бывшей черты оседлости (Украина, Беларусь, Польша), но в очень небольшом количестве. В дореволюционных списках фамилия Ремперлин почти не фиксируется, что говорит о её позднем появлении или крайней локальности.

С точки зрения словообразования, это типичная «топонимическая» модель для еврейских фамилий на -ин: человек из города X получает прозвище X-ер, а затем фамилию X-ер-ин. Ремперлин — один из таких редких случаев, когда географическая привязка сохранилась почти без искажений, хотя сама фамилия осталась на периферии ономастикона.