Фамилия Руфкина образована по самой распространённой в русской ономастике модели — с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Руфкин, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Руфка. Основа здесь — редкое каноническое имя Руф, которое восходит к латинскому Rufus, что значит «рыжий» или «красноватый». В святцах это имя встречается, хотя и нечасто: известен, например, апостол Руф, упоминаемый в Послании к Римлянам. Уменьшительная форма Руфка, скорее всего, бытовала в простонародной среде, где полные церковные имена сокращали на бытовой лад.

Словообразовательная цепочка прозрачна: Руф → Руфка (разговорный вариант) → Руфкин (сын Руфки). Интересно, что суффикс -к- в основе мог выполнять не только уменьшительную, но и уничижительную функцию — в некоторых говорах так называли человека невысокого роста или с пренебрежительным оттенком. Однако для фамилии это значение стёрлось, и сейчас оно воспринимается просто как родовое обозначение.

Фамилия крайне редкая: даже по данным современных телефонных справочников и баз переписи, Руфкины встречаются единично, в основном на юге России и в Поволжье. Это объяснимо — имя Руф никогда не было популярным, а в послереволюционные годы и вовсе вышло из обихода. В отличие от массовых фамилий вроде Иванов или Петров, Руфкина не имеет географического «гнезда» — носители разбросаны по разным регионам, что характерно для фамилий от редких имён.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Руфов, Руфин, Руфанцев) показывает, что Руфкина стоит в ряду тех, что образованы именно от уменьшительной формы. Если Руфов — прямая отсылка к полному имени, то Руфкина — более «домашний» вариант, указывающий на неформальное обращение в семье или общине. Социальный контекст здесь прост: предок носителя фамилии, скорее всего, был крестьянином или мещанином, где прозвища и сокращённые имена были нормой.

Версия о происхождении от прозвища, не связанного с именем, маловероятна: слово «руфка» в русских говорах не зафиксировано ни как название ремесла, ни как обозначение внешности или характера. Так что основная и единственная убедительная гипотеза — от имени Руф через форму Руфка.