Фамилия Рукомоисеева — один из тех редких случаев, когда прозвище сохранилось почти без изменений, а не превратилось в более привычную форму. В основе лежит глагол «рукомойничать» или существительное «рукомойник». В старину так называли не просто умывальник, а человека, который слишком тщательно, с привередливостью моет руки, или, в переносном смысле, чистюлю, брезгливого человека, который «рукомойничает» — долго и с особым ритуалом ополаскивает руки перед едой.

Обратите внимание на суффикс -еев-, а не более распространённый -ов-. Фамилии на -еев обычно образовывались от основ на мягкий согласный или на -ей. Здесь же основа — «Рукомой», но в разговорной речи прозвище могло звучать как «Рукомоисей» или «Рукомоесей» (с утратой йота и стяжением). В результате получилась фамилия, которая на слух кажется почти иностранной, хотя по корням она чисто русская, бытовая.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным губерниям России, где были сильны традиции старообрядчества. В старообрядческой среде, где ритуальная чистота (в том числе мытьё рук перед молитвой и едой) имела особое значение, прозвище «Рукомой» могло закрепиться за человеком, который строго соблюдал обряд или, наоборот, слишком демонстративно его исполнял. В документах XVIII–XIX веков встречаются крестьяне и мещане с фамилией Рукомойников, Рукомойкин — Рукомоисеева стоит в том же ряду, но с менее типичным окончанием.

Интересно, что в некоторых говорах слово «рукомой» означало не только предмет, но и человека — неряху, который льёт воду мимо рук. Однако в случае с фамилией Рукомоисеева, скорее всего, закрепилось противоположное значение — «чистоплюй». Это не оскорбительное прозвище, а скорее бытовая характеристика, которая приклеилась к предку и превратилась в фамилию, звучащую теперь как загадка для носителя.