Фамилия Рупперт — одна из тех, что пришли в русский обиход из немецкоязычной среды и сохранили память о человеке, который первым её носил. В её основе — мужское имя Рупперт, а оно, в свою очередь, восходит к древнегерманскому имени Робер. На русский язык это имя обычно переводят как «великолепие» или «блеск», что указывает на пожелание славы и почёта для того, кто его получил при рождении.

Самый известный носитель имени — Руперт Зальцбургский, епископ и миссионер, живший на рубеже VII–VIII веков. Именно он придал имени широкую известность в Центральной Европе. В 697 году Руперт развернул миссионерскую деятельность в Баварии: прибыв в Регенсбург, он обратил в христианство баварского правителя Теодона и добился от него разрешения проповедовать по всей земле. Центром своей работы он выбрал бывшую римскую колонию Ювавум, стоявшую на реке Зальцах, притоке Дуная. Теодон пожаловал ему эту землю под монастырь. Обитель возвели под крутой скалистой горой, и она получила имя святого Петра, а сама гора с тех пор зовётся Мёнхсберг, то есть «гора монахов». Вокруг монастыря быстро вырос город — во многом благодаря большим залежам соли в окрестностях. Соль дала поселению и имя: Зальцбург, то есть «Город соли».

В русской традиции фамилия Рупперт не претерпела характерных для исконных славянских фамилий суффиксальных изменений вроде -ов или -ин. Она закрепилась в своей исходной, «немецкой» форме, что типично для фамилий, которые принесли с собой иностранные специалисты, купцы или военные, осевшие в России с XVIII века. Чаще всего такие фамилии встречались среди обрусевших немцев, выходцев из Австрии и Пруссии, а также в прибалтийских губерниях. Сегодня Рупперт — редкая для России фамилия, и её носители, как правило, могут проследить свои корни до конкретного предка-иммигранта, а не до древнего русского прозвища.