Фамилия Рюрюкин — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает с произношением, а корень сразу бросается в глаза, но при этом происхождение неочевидно. Основа здесь — Рюрюка, и ключевой вопрос не в суффиксе (стандартный -ин, указывающий на принадлежность: «чей?» — Рюрюкин, то есть сын или потомок Рюрюки), а в том, что это за имя или прозвище.

Самая прямая версия — звукоподражательное прозвище. В русских говорах «рюрить» или «рюркать» означало издавать гортанные звуки, ворчать, мурлыкать, а иногда и рычать. Человек, которого прозвали Рюрюкой, мог иметь низкий, «рыкающий» голос, привычку бормотать себе под нос или, наоборот, сердито ворчать. Такие прозвища по характерной манере речи — частый источник фамилий (сравните: Бубен, Гугня, Шептун). Суффикс -юк-/-ук- в основе (Рюрюк-а) характерен для южнорусских, украинских и белорусских говоров, что указывает на возможное происхождение рода с юга или запада исторической Руси.

Вторая версия, хоть и лежит на поверхности, но менее убедительна. Соблазнительно связать фамилию с именем князя Рюрика, но для этого основа должна звучать как Рюрик или Рюриков. Форма Рюрюка — это скорее народное, уменьшительное или даже ироничное переосмысление того же корня. Вполне возможно, что в какой-то семье Рюриковых ребенка или взрослого в шутку называли Рюрюкой, и это прозвище закрепилось как отдельная фамилия. Однако первая версия — от глагола — кажется более естественной для прозвища, которое дают по поведению, а не по созвучию с именем легендарного князя.

Фамилия крайне редкая. В дореволюционных справочниках и современных телефонных книгах она почти не встречается. Это значит, что её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких небольших родов, возможно, из одной местности. Географически прозвище Рюрюка могло бытовать в рязанских, тамбовских или воронежских говорах, где «рюрить» фиксируется диалектологами. Таким образом, предок современного Рюрюкина был, вероятно, крестьянином или ремесленником, получившим меткое прозвище за свой голос или манеру речи, и это прозвище стало родовым именем.