Фамилия Рюшенков — редкая и неочевидная с точки зрения корня. В ней сразу бросается в глаза суффикс -енков, который в русских фамилиях встречается реже, чем стандартные -ов и -ин. Этот суффикс характерен для южнорусских и украинских земель, особенно для бывшей Слобожанщины и Черниговщины, где фамилии на -енко (а в русифицированной форме — на -енков) были массовым явлением. Таким образом, предок Рюшенков, скорее всего, происходил из малороссийских или южнорусских областей Российской империи.

Основа фамилии — Рюша или Рюш. Самое вероятное объяснение — это прозвище, образованное от слова «рюха» или «рюшка». В русских говорах «рюхой» называли свинью, а также небольшую деревянную чурку для игры в городки. Прозвище Рюха могли дать человеку за внешнее сходство (полнота, неуклюжесть) или за манеру поведения. Второй, менее распространённый вариант — связь с глаголом «рюшить» (шуршать, шевелиться, теребить), что могло относиться к суетливому или беспокойному человеку.

Менее правдоподобна, но теоретически возможна версия о происхождении от имени Рюрик через уменьшительную форму Рюша. Однако на практике фамилии от Рюрика встречаются крайне редко и обычно выглядят как Рюриков. Форма Рюшенков с суффиксом -енков указывает скорее на бытовое, народное прозвище, чем на княжеское имя.

География фамилии подтверждает южное происхождение. По данным современных телефонных справочников и архивов, Рюшенковы чаще всего встречаются в Белгородской, Воронежской и Ростовской областях, а также на Украине. За пределами этих регионов фамилия практически не фиксируется, что говорит о локальном бытовании и отсутствии массового расселения.

В сословном отношении Рюшенковы, скорее всего, были крестьянами или однодворцами — потомками служилых людей, охранявших южные границы России. Фамилия не относится к дворянским и не встречается в родословных книгах, что лишний раз указывает на её народное, прозвищное происхождение.