Фамилия Рыжутина в своей основе содержит прозвище Рыжута. В русской ономастике суффикс «-ут(а)» — один из характерных, хотя и не самых частых, способов образования прозвищ от прилагательных. Сравните: Рыжута, Чернута, Белута, Холстута. Этот суффикс придавал слову оттенок уменьшительности или, скорее, неполноты признака. Рыжута — это не просто «рыжий», а «рыжеватый», «с рыжинкой». Такое прозвище могли дать человеку с рыжеватыми волосами или бородой, но не обязательно ярко-огненного цвета, а с заметным отливом.

От прозвища Рыжута по стандартной модели образовалась фамилия Рыжутин. Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: «чей сын?» — Рыжутин, то есть сын или потомок Рыжуты. Это типичная патронимическая фамилия, распространённая в северных и центральных русских землях, где формы на «-ин» преобладали над «-ов» у основ на -а, -я.

В отличие от более распространённой фамилии Рыжов, которая образована напрямую от прилагательного «рыжий», Рыжутина встречается заметно реже. Это говорит о том, что её носители, скорее всего, происходят из одной или нескольких локальных ветвей, а прозвище Рыжута могло бытовать в конкретной местности — например, в Вологодской, Архангельской или Костромской губерниях, где такие суффиксальные формы в прозвищах были в ходу.

Встречается и вариант написания через «о» — Рыжотин, но он менее характерен. Ударение в фамилии обычно падает на второй слог: Рыжу́тина. Если вы носите эту фамилию, ваши предки в XVI–XVII веках могли быть крестьянами или посадскими людьми, получившими прозвище за необычный оттенок волос, который отличал их в деревне.