Фамилия Рзабекова — женская форма фамилии Рзабеков, и её корни ведут в тюрко-мусульманскую среду. Основа здесь — составное имя Рзабек, где первая часть восходит к арабскому «риза» — довольство, согласие, а вторая — тюркское «бек» (князь, господин, предводитель). В целом имя означает что-то вроде «довольный господин» или «удовлетворённый бек». Такие двусоставные имена с компонентом «бек» были особенно распространены у народов Кавказа, Поволжья и Средней Азии.

Суффикс -ов в фамилии Рзабеков — классический русский патронимический суффикс, который в XIX–XX веках активно добавляли к тюркским именам при русификации. То есть фамилию образовали по модели «имя отца + -ов»: сына Рзабека записывали как Рзабеков. Женский вариант Рзабекова, соответственно, передаётся по наследству от мужа или отца.

Географически фамилия тяготеет к азербайджанской, дагестанской и, реже, казахской среде. Встречается она нечасто, что говорит о её локальном характере: скорее всего, родоначальник был заметным человеком в своей общине — либо старшиной, либо духовным лицом, раз имя включало титул «бек». В Российской империи такие фамилии нередко фиксировали у выходцев из Закавказья, которые переходили на русскую документацию.

С точки зрения словообразования, фамилия Рзабекова отличается от более частых вариантов вроде Рзаев или Рзалиев: она сохраняет полную форму имени, а не усекает его до корня. Это делает её более «прозрачной» для этимологии, но и более редкой. Если сравнивать с однокоренными фамилиями, Рзабекова стоит ближе к аристократическому словоупотреблению, где «бек» указывал на происхождение, а не на личное качество.