Фамилия Сабусов неоднородна по происхождению, и за ней стоит как минимум две версии, заметно отличающиеся друг от друга. Самая вероятная из них связывает фамилию с прозвищем Шабус, а значит, с белорусским словом «шабуня» — «шутник, шутница». В этом случае фамилия Сабусов — фонетический вариант фамилии Шабусов: замена начального «Ш» на «С» в просторечии и при оформлении документов встречалась нередко. Прозвище Шабус, скорее всего, указывало на характер предка: весёлого, жизнерадостного человека, балагура, который получил своё именование за склонность к шуткам. Такие прозвища закреплялись за человеком как наиболее употребительное обращение, а со временем легли в основу фамилии.

Вторая версия уводит в совсем иную область — в древнюю историю. Согласно ей, фамилия Сабусов могла иметь искусственное происхождение и восходить к имени бога Сабуса, который покровительствовал воинственному народу сабинов. По преданиям, предки сабинов до прихода в Италию жили в Лакедемоне, то есть в Спарте. Эта гипотеза выглядит менее убедительной: она не объясняет, каким образом древний бог или целый народ попал в основу русской фамилии, и не подкреплена ономастической традицией. Скорее всего, здесь мы имеем дело с поздним книжным переосмыслением, тогда как бытовая версия с прозвищем Шабус проще и ближе к реальной практике именования.

Словообразовательная модель фамилии стандартна для русской ономастики: суффикс -ов присоединялся к основе прозвища, образуя притяжательное прилагательное, которое затем закрепилось как фамилия. Так потомок человека по прозвищу Шабус со временем получил фамилию Сабусов. В написании фамилии отразилась особенность произношения: глухой начальный звук в белорусском слове воспринимался по-разному, отсюда и два варианта — Шабусов и Сабусов, которые сосуществуют и сегодня.