Фамилия Самерханов образована от мужского тюркского имени Самерхан. Первая из них восходит к имени Самар, которое в переводе с арабского означает «плод, результат, полезный». В основу фамилии лег диалектный вариант имени – Самер. Первоначально «хан» обозначал вождя племени (например, у кочевников Ирана и Афганистана). Таким образом, потомок человека, которого звали Самерхан, со временем получил фамилию Самерханов.