Фамилия Самковський — это украинский или польский вариант, образованный по модели на «-ський»/-ский. Суффикс «-ськ-» указывает на происхождение от географического названия: такую фамилию получал человек, который жил в определённом месте, владел им или оттуда родом. Основа «Самков-» восходит к имени Самко — уменьшительной форме от Самуил (древнееврейское «услышанный Богом») или от Самсон (еврейское «солнечный»). В старых украинских и польских документах Самко фигурирует как самостоятельное имя, а не только как сокращение.

Географически фамилия Самковський тяготеет к западноукраинским землям — Галиции, Волыни, а также к Подляшью и другим историческим областям Речи Посполитой. Там топонимы с корнем «Самк-» встречаются, хотя и редки. Например, могло быть село Самков, Самковичи или урочище Самково — оттуда и пошёл первый носитель фамилии. В этом случае окончание «-ський» работает как «из Самкова» или «самковский».

Менее вероятна, но возможна версия, что Самковський — фамилия от прозвища Самко, которое в диалектах могло означать «сам себе хозяин», «самостоятельный человек» или даже «одиночка». Тогда суффикс «-овський» просто указывал на принадлежность к роду Самка.

Отличительная черта этой фамилии — её редкость. В отличие от массовых Самойловых или Самсоновых, Самковський не получил широкого распространения, что характерно для фамилий, привязанных к конкретному небольшому селу или хутору. Именно поэтому носители этой фамилии, скорее всего, происходят из одного компактного региона, а не разбросаны по всей Украине или Польше.