Фамилия Самофаева — редкий случай среди русских фамилий, где в основе лежит не имя, не профессия и не географическое название, а глагольная форма повелительного наклонения. Первое, что бросается в глаза: корень «Само-» здесь не имеет отношения к слову «сам». Это усечённая часть древнерусского имени или прозвища, образованного по модели «глагол в повелительном наклонении + имя».

Разбираем фамилию по составу: Самофаев — это отчество от прозвища Самофай. А Самофай, в свою очередь, — народная форма от канонического имени Самуил. В русской традиции имя Самуил часто сокращали и переделывали: Самоха, Самойло, а в некоторых говорах — Самофай. Суффикс «-ай» в таких именах (сравните: Мал — Малай, Косой — Косай) придавал прозвищу характерный просторечный оттенок. Таким образом, Самофаев буквально означает «сын Самофая», то есть потомок человека по имени Самуил.

Вторая, менее вероятная версия, но имеющая право на существование, связывает фамилию с диалектным глаголом «самофать» — так в некоторых областях называли человека, который делает всё по-своему, самодурствует. Однако эта гипотеза слабая: в письменных источниках такой глагол не зафиксирован, а фамилии от повелительного наклонения редки и обычно образуются от коротких прозвищ вроде «Уймигора» или «Сорвиголова».

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским землям. Встречается в Воронежской, Курской, Ростовской областях, а также на Кубани. Это указывает на то, что предки носителей фамилии были выходцами из чернозёмных губерний, где имя Самуил было особенно популярно среди крестьянства.

Что касается суффикса «-ев», он стандартный для русских фамилий, образованных от основ на мягкий согласный или «й». В данном случае «Самофай» дал «Самофаев» (не путать с более редкой формой «Самофаев» через «ё» — в дореволюционных записях такое написание встречалось, но не прижилось).

Таким образом, Самофаева — это фамилия-отчество от народной формы библейского имени. Её носители — потомки тех, кого в быту звали Самофай вместо Самуил. Никакой тайны или сложной символики: обычная русская фамилия, за которой стоит простое имя, прошедшее через живую народную речь.