Фамилия Сандухян — армянская по происхождению, и её стоит рассматривать в контексте армянской ономастики, а не русской. В армянском языке фамилии образуются иначе, чем в славянских: здесь нет суффиксов -ов или -ин. Типичный фамильный формант — -ян (или -янц в более старой, западноармянской традиции), который восходит к древнему показателю принадлежности. Сандухян буквально означает «из рода Сандуха» или «принадлежащий Сандуху». Основа здесь — личное имя Сандухт.

Имя Сандухт — древнеармянское женское имя, которое состоит из двух частей: «санду» (по одной из версий, от иранского корня, означающего «камень», «скала», но это спорно) и «духт» — «дочь» (от среднеперсидского duxt, родственного русскому «дочь»). Таким образом, Сандухт — это «дочь камня» или, в более поэтичном прочтении, «каменная дочь». В армянской истории известно несколько знатных женщин с таким именем, например, Сандухт — царевна из династии Аршакидов, которая, по преданию, приняла христианство от святого Григория Просветителя. Однако фамилия Сандухян не обязательно восходит к царскому роду — имя было довольно распространённым, и фамилию мог получить потомок любой женщины по имени Сандухт.

С точки зрения словообразовательной модели, Сандухян — это патроним (фамилия по отцу или предку), но с женским именем в основе. В армянской традиции это нормально: фамилии могли образовываться от имён матерей, особенно если женщина была известна в роду. Суффикс -ян указывает на происхождение, аналог русского «сын такого-то». Встречается и вариант Сандухянц (с окончанием -янц), который характерен для западных армян, живших на территории Османской империи. Носители фамилии Сандухян в основном расселены в Армении, а также в диаспорах — в России, США, Ливане и Сирии, куда армяне переселились после геноцида 1915 года.

Сравнивать эту фамилию с русскими не стоит — у неё другая природа. Но если искать параллели в русском языке, то по смыслу она близка к фамилиям типа Дочкин (редкая, от женского имени Дочка) или, условно, Марьин (от имени Мария). Однако в русской традиции фамилии от женских имён встречаются реже и часто носят пренебрежительный оттенок, чего нет в армянской культуре. Сандухян — фамилия с ясной этимологией, указывающая на конкретное женское имя в основе, и её носители могут с уверенностью связывать свой род с древней армянской традицией именования.