Фамилия Санияхметова — редкая, составная, образованная по тюрко-персидской модели. Её основа — мужское имя Санияхмет, которое в свою очередь сложено из двух компонентов: арабского «сани» (второй) и «Ахмет» (одна из форм имени Ахмад, «достохвальный»). Буквально имя означает «второй Ахмет» или «второй достохвальный». Такие сложные имена с порядковым числительным («второй», «третий») давали в мусульманских семьях, когда хотели повторить имя уже умершего или уважаемого родственника, но при этом избежать буквального совпадения. Числительное «сани» уточняло, что это не сам покойный, а его «продолжатель» или тёзка во втором поколении.

Фамилия оформлена русским патронимическим суффиксом -ов, но в женском роде — Санияхметова. Для мужчины полная форма — Санияхметов. Такое сочетание тюрко-персидского имени с русским окончанием типично для татар, башкир и других народов Поволжья и Приуралья, где после принятия христианства или в ходе русификации документов фамилии записывали по русскому образцу. В самой фамилии нет указания на сословие или профессию — она прямо указывает на предка по имени Санияхмет.

Встречается фамилия преимущественно в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области. Из-за редкости её носители, скорее всего, происходят из одного родового гнезда, а не разбросаны по разным регионам случайно. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках она почти не фиксируется — это говорит о том, что оформилась она поздно, возможно, уже в советское время, когда паспортизация закрепила фамилии по отчеству.

Другие версии происхождения маловероятны. Например, попытка вывести фамилию от арабского «сания» (высокий, возвышенный) не объясняет наличия «хмет» в середине. Скорее всего, перед нами именно двухкоренное имя, а не искажённое географическое название или прозвище.