Фамилия Санкаускас — литовская, и это сразу многое объясняет. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев или -ин, литовские фамилии часто оканчиваются на -ас, -ис, -ус, и Санкаускас — типичный пример такой модели. Это отчество или прозвище, застывшее в форме мужского рода.

Основа фамилии — «Санкаус» (Sankauskas). Скорее всего, она восходит к литовскому слову sankausa или sankausas, которое означает «скупой», «бережливый», «прижимистый». В прямом смысле — «тот, кто копит, не тратит лишнего». Такие прозвища в Литве давали не столько как оскорбление, сколько как характеристику: человек, который умеет обращаться с добром, не транжира. В крестьянской среде это могло быть даже уважаемым качеством.

Суффикс -auskas (в русской передаче -аускас) — один из самых распространённых в литовской ономастике. Он образует фамилии от прозвищ, имён или названий местности. В данном случае Санкаускас — это буквально «сын (или потомок) Скупого». Аналог в русском языке — фамилия Скупцов или Скупов, но с той разницей, что в литовском суффикс -auskas указывает на происхождение от конкретного лица, а не на принадлежность к роду.

Географически фамилия Санкаускас встречается в основном в Литве, особенно в северных и центральных районах (Жемайтия, Аукштайтия). В России и Беларуси она редка и обычно принадлежит потомкам литовцев, переселившихся в XIX–XX веках. Вариант написания с «Санк-» вместо «Санк-» (в литовском ударение на первый слог) — результат адаптации к кириллице.

Никаких спорных версий здесь нет: корень ясный, модель образования типичная. Носители фамилии не были дворянами — это крестьянская или мещанская фамилия, возникшая не раньше XVII–XVIII веков, когда в Литве закрепилась система наследственных прозвищ. Если ваш предок — Санкаускас, то он, скорее всего, был бережливым хозяином, и это качество закрепилось за ним настолько, что перешло в фамилию.