Фамилия Санышенко — яркий пример украинской модели фамилии на -енко, которая в XVII–XVIII веках распространилась на Левобережной и Слободской Украине. Суффикс -енко (а также -ко) изначально был уменьшительным, но в фамилиях он закрепился как указание на сына или потомка: Санышенко буквально значит «сын Саныша» или «потомок Саныша». То есть перед нами не просто фамилия, а отчество третьей степени, образованное от личного имени через промежуточную форму.

Корень здесь — Саныш. Это краткая, народная форма от церковного имени Александр. На Украине и в южнорусских землях имя Александр дробилось на множество производных: Саня, Саша, Сашко, а также Саныш, где суффикс -ыш (-иш) выполнял ту же уменьшительно-ласкательную роль, что и в словах «глупыш», «малыш». Таким образом, цепочка простая: Александр → Саныш (домашнее прозвище) → Санышенко (сын Саныша). В русской традиции аналогичную модель дал бы суффикс -ов: Санышев, но украинская огласовка сохранилась в фамилии Санышенко.

С географической точки зрения фамилия тяготеет к регионам, где была сильна традиция украинского фамильного суффикса -енко: это прежде всего Полтавщина, Черниговщина, Киевщина, а также южные области России, куда в XVIII–XIX веках переселялись украинские крестьяне и казаки (Кубань, Ставрополье, Донбасс). Встречается Санышенко и в центральных областях России, но как более редкий вариант — результат миграций.

Важный нюанс: фамилия Санышенко не стоит в одном ряду с Санышев или Санышко. Первая — однозначно украинская по форме, вторая — русская, а третья — тоже украинская, но с другим суффиксом. Если у вас в роду есть Санышенко, это с большой вероятностью указывает на украинские корни или на происхождение из среды украинских переселенцев. Социально фамилия неаристократическая: такие фамилии на -енко обычно носили крестьяне, казаки, мещане. Никаких дворянских родов с этой фамилией в исторических документах не зафиксировано.

Встречаются варианты написания: Санышенко, реже Санышенко с ударением на второй слог (Саны́шенко) или на предпоследний (Саныше́нко). В официальных документах XIX века могли писать и через «и» — Санишенко, но это скорее искажение при записи.