Фамилия Сайготина — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все остальные версии. Её основа — топоним Сайгатка, название реки в Пермском крае, а также села Сайгатка, которое в XIX веке входило в Оханский уезд. Жителей этой местности называли сайгатцами, а выходца — Сайгатка, отсюда и фамилия. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Сайготин, то есть «сын Сайгатки» или «человек из рода Сайгаткиных». Ударение в фамилии падает на второй слог: Сайгóтина.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с прозвищем от слова «сайга» — степная антилопа. Однако это маловероятно: сайгаки обитают в южных степях, а фамилия явно закрепилась на Урале и в Прикамье. В говорах Пермского края слово «сайга» могло означать «крикун» или «задира», но документальных подтверждений этому нет.

Обратите внимание на написание: в основе — «Сайгат-», а не «Сайгот-». Буква «о» в корне — результат аканья или диалектного произношения, которое закрепилось на письме. В документах XVIII—XIX веков можно встретить варианты Сайгатин, Сайгаткин, но современная форма Сайготина — наиболее устойчивая. Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская, что типично для фамилий, образованных от названий малых сёл и рек. В справочниках по русским фамилиям (например, у Б. Унбегауна) подобные модели разбираются как «топонимические фамилии на -ин» — их носителями были люди, чьи предки переселились из одного места в другое и получили прозвище по месту выхода.