Фамилия Сайидо — редкая для России, и её происхождение ведёт не в славянскую, а в арабо-персидскую среду. В основе лежит арабское слово «сайид» (سيد) — «господин», «повелитель», а в исламской традиции — почётный титул потомков пророка Мухаммеда через его внука Хусейна. Фамилия Сайидо — это, скорее всего, русифицированная форма восточной фамилии или имени, распространённая у народов, исторически исповедующих ислам: таджиков, узбеков, народов Северного Кавказа. Окончание на -о в русской записи — характерный признак адаптации: так часто передавали фамилии из тюркских и иранских языков, где исходная форма могла звучать как Сайид, Сайидов или Сайидзода.

Словообразовательная модель здесь нестандартная для русской системы. Если бы фамилия образовалась в русском языке, она получила бы суффикс -ов (Сайидов) или -ев. Форма Сайидо сохранила исходный корень без наращивания, что говорит о её сравнительно позднем закреплении в документах — возможно, в советский период, при паспортизации, когда записывали так, как слышали. Носители такой фамилии — это люди, чьи предки принадлежали к духовному сословию или вели род от уважаемых религиозных деятелей. В Таджикистане и Узбекистане фамилия Сайидо встречается у потомков суфийских шейхов и учёных, а на Кавказе — у аварцев или лезгин, где титул «сайид» тоже был распространён.

Других, более прозаичных версий у этой фамилии нет: она не связана с ремёслами, географическими названиями или прозвищами. Спорным может быть только вопрос, является ли Сайидо исходной фамилией или усечённой формой от Сайидов — в пользу первой говорит то, что в тех же языках встречаются фамилии без суффиксов (например, Ахмед, Рашид), которые в русском контексте не склоняются. Склонение фамилии Сайидо — нулевое, как у всех фамилий на гласный: она не меняется по падежам.