Фамилия Сайтгалин — одна из тех, что сразу указывает на тюркские корни и мусульманскую традицию именования. В её основе лежит сложное личное имя Сайтгали (или Сайтгалей), которое состоит из двух компонентов: арабского «сайид» (господин, потомок пророка) и «гали» (высокий, великий, дорогой). Таким образом, имя Сайтгали означает «великий господин» или «высокочтимый потомок пророка». Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ин, который в Поволжье и Приуралье часто добавляли к тюркским именам, превращая их в фамилии: Сайтгалин — «сын Сайтгали».

Суффикс -ин, а не -ов, в этой фамилии не случаен. В русской ономастике он традиционно присоединялся к основам на мягкий согласный или на -а/-я. Но у татар, башкир и других тюркских народов, особенно в XIX веке при массовой фиксации фамилий, выбор между -ов и -ин часто диктовался просто местной канцелярской традицией или благозвучием. Фамилия Сайтгалин встречается в основном среди татар и башкир, что подтверждает её происхождение из среды волго-уральских мусульман. Могли быть и варианты написания: Сайтгалеев, Сайтгалиев, но форма с -ин закрепилась как основная.

Имя Сайтгали было популярно в среде мусульманского духовенства и зажиточных крестьян, так как содержало почётный титул «сайид». Предок носителя фамилии, скорее всего, был человеком уважаемым в своей общине — либо муллой, либо зажиточным крестьянином или торговцем. В отличие от многих русских фамилий, образованных от мирских имён или прозвищ, Сайтгалин несёт в себе прямую религиозную и социальную маркировку: его носитель происходит от человека, которого при рождении нарекли «великим господином».

Встречается фамилия преимущественно в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Известных носителей, широко прославивших фамилию на всю страну, нет — это типичная фамилия сельской интеллигенции и рабочих династий.