Фамилия Сайтыханов — одна из тех, что ясно указывает на тюркские корни и почти наверняка на исламскую традицию именования. В её основе лежит сложносоставное мужское имя Сайтыхан, которое в свою очередь распадается на два компонента: «Сайт» и «хан». «Сайт» (или «Саид») — арабского происхождения, означает «господин», «предводитель», «счастливый». В мусульманском мире это почетный титул потомков пророка Мухаммеда. Вторая часть — «хан» — тюркский титул верховного правителя, князя. Соединение этих двух элементов в одном имени (Сайты + хан) давало значение «господин-хан» или «счастливый правитель» — имя с явной претензией на знатность и уважение.

Русская фамилия образовалась по классической модели присоединения патронимического суффикса -ов. Сайтыханов буквально означает «сын Сайтыхана» или «потомок Сайтыхана». Такая форма характерна для фамилий, которые складывались у тюркских народов в составе Российской империи в XIX — начале XX века, когда при крещении или переходе в православие, а также при простой записи в ревизские сказки, к тюркскому имени добавляли русский суффикс. В отличие от многих татарских или башкирских фамилий, оканчивающихся на -ин (например, Сайтыханов, а не Сайтыханин), здесь сработала модель с фамильным суффиксом -ов, который был универсальным для большинства нерусских народов Поволжья и Урала.

Географически фамилия Сайтыханов чаще всего встречается среди башкир и татар, особенно в южных и восточных районах Башкортостана, а также в Челябинской и Оренбургской областях. Встречается она и у казахов, но в русском написании через «в» на конце указывает на то, что фамилия оформлялась в русской канцелярской традиции. Исходное имя Сайтыхан не было редким, и носителей фамилии, скорее всего, объединяет не кровное родство, а происхождение от разных людей, носивших это популярное имя.

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна: основа (имя) + суффикс (-ов). Никаких редких или спорных суффиксов вроде -их или -ский нет. Интереснее другое: двойная семантика основы. Если первая часть имени «Сайт» восходит к арабскому «са’ид» (счастливый, благополучный), то в тюркской среде она могла смешиваться с местными диалектными формами. Например, в некоторых говорах «сайт» означает «ровный», «гладкий», но это скорее народная этимология, нежели реальный корень. Основная, документально подтвержденная версия — арабо-мусульманская, с титулом «Саид».

Таким образом, Сайтыханов — фамилия, которая говорит о предке, носившем двусоставное мусульманское имя с элементами арабской и тюркской знатности. По социальному происхождению её носители могли быть как из числа служилых татар или башкирских вотчинников, так и из крестьян, но само имя указывает на то, что предок не был человеком без роду и племени.